Сибирский федеральный университет

Тип публикации: статья из журнала

Год издания: 2021

Идентификатор DOI: 10.14258/pbssm.2021074

Ключевые слова: genetic polymorphism, ISSR-PCR analysis, phylogeny, генетический полиморфизм, филогения, ISSR-PCR анализ, Trollius

Аннотация: Trollius L. - род растений из семейства Ranunculaceae Juss., имеющих декоративное и прикладноезначение. На территории Сибири отмечается наибольшее разнообразие представителей данного рода. В ходеисследования был проведён популяционно-генетический анализ 7 популяций Trollius asiaticus, 2 популяций T. vitalii и 1 популяции T. sibiricus, произрастающих на юге Сибири с использованием ISSR-PCR маркеров. Выявлено 114 локусов, суммарный полиморфизм которых составляет 98,25 %. Число амплифицированных фрагментовв зависимости от праймера варьирует от 27 (17899A) до 32 (ISSR-17 и HB14). Коэффициент подразделённостипопуляций (GST) составляет 0,5186, следовательно, изученные популяции имеют высокую степень дифференциациипо классификации Райта и разделяются на отдельные виды. На дендрограмме сходства популяций выделяется2 кластера, один из которых формируют популяции, относящиеся к виду T. sibiricus. Во второй кластер входятпопуляции T. asiaticus и T. vitalii. Обособленную группу, предположительно относящуюся к новому виду T. austrosibiricus Erst et Luferov, образуют байкальская и иджимская популяции. При построении дерева по отдельнымпредставителям наблюдается четкое разделение популяций на обособленные группы. При проведении филогенетического анализа по нуклеотидным последовательностям ITS регионов, хлоропластных генов matK и rbcL быловыявлено отсутствие значимых различий между видами T. asiaticus, T. vitalii, T. kolonok, T. europaeus L., T. altaicusи T. sibiricus. Единичные однонуклеотидные замены отмечены в последовательностях matK у T. europaeus, T. altaicus и T. kolonok. Trollius L. - plant genus of Ranunculaceae Juss. family that has decorative and practical applications. Onthe territory of Siberia, the greatest diversity of representatives is noted. During the study, a population genetic analysis for7 populations of T. asiaticus, 2 populations of T. vitalii and 1 population of T. sibiricus was carried out. Revealed 114 loci,the total polymorphism of which is 98.25 %. The number of amplified fragments is related to the primer and range from27 (17899A) to 32 (ISSR-17 and HB14). GST is 0,5186, therefore, the studied populations have a high degree of differentiation according to the classification of Wright’s classification and are divided into separate species. On the dendrogram of population similarity, 2 clusters are distinguished, one of which is formed by populations belonging to the speciesT. sibiricus. The second cluster includes populations of T. asiaticus and T. vitalii. A separate group that, probably, belongsto T. austrosibiricus Erst et Luferov is formed by the Baikal and Idzhim populations. When constructing a tree for individual representatives, a clear division of populations into separate groups is observed. Phylogenetic analysis of the nucleotidesequences of the ITS regions, chloroplast genes matK and rbcL revealed the absence of significant differences between thespecies T. asiaticus, T. vitalii, T. kolonok, T. europaeus L., T. altaicus, and T. sibiricus. SNPs were noted in the matK sequences in T. europaeus, T. altaicus, and T. kolonok.

Журнал: Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии

Выпуск журнала: № 20-1

Номера страниц: 367-372

ISSN журнала: 23133929

Место издания: Барнаул

Издатель: Алтайский государственный университет

• Путилин И.Р. (Сибирский федеральный университет)
• Ямских И.Е. (Сибирский федеральный университет)
• Степанов Н.В. (Сибирский федеральный университет)
• Куцев М.Г. (Алтайский государственный университет)

• РИНЦ (eLIBRARY.RU)