Сибирский федеральный университет

Перевод названия: COMPARATIVE QUANTUM-CHEMICAL ANALYSIS OF THE ELECTRONIC STRUCTURES OF THE VALENCE REGIONS OF ACTIVE SITES IN CYTOCHROMES f AND с

Тип публикации: статья из журнала

Год издания: 2004

Ключевые слова: гемопротеины, ZINDO1, Hemoproteins, Heme, electronic structure, electron transport, ГЕМ, электронная структура, электронный транспорт

Аннотация: Квантовохимическим полуэмпирическим методом ZINDO1 проведен сравнительный анализ плотности состояний валентных областей гемов и кластеров цитохромов f и c. Показано, что молекулярные орбитали данных структур сформированы p-орбиталями атомов азота и углерода порфиринового кольца, которые делают одинаковые вклады. При расчете систем с отрицательными зарядами добавленные электроны более чем наполовину распределяются в порфириновых частях молекул. Энергии молекулярных орбиталей валентных областей соответствующих кластеров и гемов практически совпадают. В железопорфирине, геме f и кластере цитохрома f нижняя вакантная молекулярная орбиталь дважды вырождена. В геме c и кластере цитохрома c из-за несимметричности ближайшего аминокислотного окружения и заместителей в порфириновом кольце данное вырождение снимается. A comparative analysis of densities of states has been carried out for the valence regions of the hemes and clusters of cytochromes f and c using the ZINDO1 semiempirical quantum-chemical method. The molecular orbitals of these structures are formed from the p atomic orbitals of nitrogen and carbon of the porphyrin ring, making equal contributions. For systems with negative charges, more than half of all added electrons are distributed over the porphyrin parts of the molecules. The molecular orbital energies of the valence regions of the corresponding clusters and hemes are nearly the same. In iron porphyrin, as well as in heme f and cytochrome cluster f, the lowest unoccupied molecular orbital is doubly degenerate. In heme c and cytochrome cluster c, the degeneracy is lifted because of the asymmetry of the nearest aminoacid environment and substituents in the porphyrin ring.

Журнал: Журнал структурной химии

Выпуск журнала: Т. 45, № 2

Номера страниц: 199-206

ISSN журнала: 01367463

Место издания: Новосибирск

Издатель: Федеральное государственное унитарное предприятие Издательство Сибирского отделения Российской академии наук

• Романова Т.А. (Институт вычислительного моделирования СО РАН)
• Краснов П.О. (Институт физики им. Л.В. Киренского СО РАН)
• Кузубов А.А. (Институт физики им. Л.В. Киренского СО РАН)
• Аврамов П.В. (Институт физики им. Л.В. Киренского СО РАН)

• Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
• Список ВАК