Сибирский федеральный университет

Тип публикации: патент

Год издания: 2017

Аннотация: Программа предназначена для генерации геномных данных с указанием количества и длины повторов, процента мутаций, качества покрытия генома ридами и вероятности встречи определенных нуклеотидов в геноме. Программа может быть использована при разработке, отладке и тестировании программных комплексов обработки геномных данных. Программа позволяет: настраивать длину генерируемого генома; настраивать параметры генерации повторов: общее количество повторов, количество появлений конкретного повтора и его длину; настаивать вероятность мутаций, вставок и удалений; настраивать вероятности отдельных нуклеотидов при генерации ридов и повторов; настраивать длину рида, частоту выборки рида из генома и количество выборок; сохранять все сгенерированные данные: цельный геном, повторы, риды; печатать статистику мутаций и покрытия генома ридами.

• Цыбин Александр Николаевич
• Кузьмин Дмитрий Александрович

• РИНЦ (eLIBRARY.RU)