Программный комплекс фильтрации повторяющихся последовательностей (рипитов) в ридах NGS Illumina : регистрация программы для ЭВМ | Научно-инновационный портал СФУ

Программный комплекс фильтрации повторяющихся последовательностей (рипитов) в ридах NGS Illumina : регистрация программы для ЭВМ

Тип публикации: патент

Год издания: 2015

Аннотация: Программа предназначена для использования в качестве одного из этапов подготовки геномных данных к этапу ассемблирования с сохранением последовательностей, кодирующих белки. Программа позволяет: выделять рипиты из исходных данных (ридов); кластеризовать риды по признаку «похожести»; выводить статусы выполнения программы для обеспечения совместимости с системами пакетного выполнения задач; генерировать отчет по выполненной фильтрации; обрабатывать большие массивы данных (более 250 Гб на файл); использовать оптимизацию памяти для количества ридов в пределах 4-8 млрд. с использованием 33-битовых целых чисел; использовать вычислительные возможности многопроцессорных архитектур.

Ссылки на полный текст

Персоны

Вхождение в базы данных

Информация о публикациях загружается с сайта службы поддержки публикационной активности СФУ. Сообщите, если заметили неточности.

Вы можете отметить интересные фрагменты текста, которые будут доступны по уникальной ссылке в адресной строке браузера.