Перевод названия: Application of Numerical Optimization Methods to Perform Molecular Docking on Graphics Processing Units
Тип публикации: статья из журнала
Год издания: 2014
Ключевые слова: дифференциальная эволюция, gpgpu, Cuda, molecular docking, virtual screening, ligand-protein docking, молекулярный докинг, виртуальный скрининг, лиганд-белковый докинг
Аннотация: В работе проведён анализ методов оптимизации для решения задачи молекулярного докинга. Сформированы дополнительные требования, предъявляемые к методам оптимизации при их реализации на графических процессорах. Выбран перспективный метод для графических процессоров и продемонстрирована его реализация. An analysis of numerical optimization methods for solving a problem of molecular docking has been performed. Some additional requirements for optimization methods according to GPU architecture features were specified. A promising method for implementation on GPU was selected. Its implementation was described and performance and accuracy tests were performed.
Издание
Журнал: Моделирование и анализ информационных систем
Выпуск журнала: Т. 21, № 5
Номера страниц: 93-101
ISSN журнала: 18181015
Место издания: Ярославль
Издатель: федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Ярославский государственный университет им. П.Г. Демидова"
Персоны
- Фарков Михаил Александрович (Сибирский Федеральный Университет Россия)
- Легалов Александр Иванович (Сибирский Федеральный Университет Россия)
Вхождение в базы данных
- Ядро РИНЦ (eLIBRARY.RU)
- Список ВАК
Информация о публикациях загружается с сайта службы поддержки публикационной активности СФУ. Сообщите, если заметили неточности.