Разработка метода определения аллельной нагрузки соматической мутации V617F в гене JAK2 (янус-киназы-2) в пулах проб венозной крови

Перевод названия: Developing method for allelic somatic mutations burden of Janus kinase 2 (V617F JAK2) detection in pools of venous blood samples

Тип публикации: статья из журнала

Год издания: 2016

Ключевые слова: allele-specific RT-PCR, V617F JAK2, genetic screening, аллель-специфическая ПЦР-РВ, мутация V617F в гене Jak2, молекулярно-генетический скрининг

Аннотация: Тест на выявление мутаций в гене JAK2 включен в клинические рекомендации ВОЗ в качестве одного из основных диагностических критериев хронических миелоидных опухолей. Вместе с тем, распространенность мутации V617F JAK2 среди добровольцев, не имеющих онкогематологического заболевания, составляет от 0,15 до 1,2%. При этом отсутствуют сведения об эффективности молекулярно-генетических скрининговых исследований для выявления мутации V617F JAK2 при тестировании пулированных образцов. Цель работы — сравнение результатов анализа мутации V617F JAK2, полученных при использовании разработанного метода и коммерческих наборов российских производителей, а также демонстрация возможности использования разработанной методики для анализа указанной мутации в пулированных образцах венозной крови. Материалы и методы. С целью выявление мутации V617F в гене JAK2 использовали разработанный в нашей лаборатории набор реактивов для метода аллель-специфической полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (ПЦР-РВ). Результаты. Продемонстрирована возможность проведения скрининга в пулированных образцах венозной крови. Показана высокая корреляция (R2 от 0,86 до 0,94) результатов количественного определения аллельной нагрузки V617F JAK2 с результатами, полученными в тех же пробах при использовании коммерческих наборов для ПЦР-РВ производства ООО «НПК Синтол» и ООО «ГеноТехнология», а также с результатами теста количественного пиросеквенирования фирмы «Интерлабсервис». Среди 485 «неинтерпретируемых» или «отрицательных» в тест-системе ООО «НПФ Литех» результатов тестирования 44 были положительными при использовании альтернативных наборов. При этом уровень аллельной нагрузки V617F JAK2 в этих пробах находился в пределах клинической значимости от 0,24 до 40,4% (Ме =9,6%). Выводы. Предел аналитической чувствительности (0,06%) и близкая к 100% (р<0,001) специфичность, а также высокая корреляция количественных результатов «in house» метода с коммерческими наборами, позволяет предложить его использование при тестировании пулов проб крови в скрининге пациентов с клинически значимыми уровнями аллельной нагрузки мутации V617F JAK2.

Ссылки на полный текст

Издание

Журнал: Лабораторная служба

Выпуск журнала: Т.5, 1

Номера страниц: 19-25

ISSN журнала: 23052198

Место издания: Москва

Издатель: Общество с ограниченной ответственностью Издательство Медиа Сфера

Авторы

  • Горбенко А.С. (Красноярский филиал ФГБУ «Гематологический научный центр» Минздрава России)
  • Столяр М.А. («Красноярский научный центр Сибирского отделения РАН», Красноярск)
  • Субботина Т.Н. («Сибирский федеральный университет»)
  • Михалёв М.А. («Городская клиническая больница №7», Красноярск)
  • Ольховский И.А. (Красноярский филиал «Гематологический научный центр» Минздрава России, Красноярск, Россия)

Вхождение в базы данных

Информация о публикациях загружается с сайта службы поддержки публикационной активности СФУ. Сообщите, если заметили неточности.

Вы можете отметить интересные фрагменты текста, которые будут доступны по уникальной ссылке в адресной строке браузера.